안동시(시장 ; 김휘동)에서는 2009. 11. 3부터 전염병 위기단계가 현행 『경계』에서『심각』단계로 상향 조정됨에 따라 시장을 본부장으로 하는 안동시신종인플루엔자 대책본부를 새로 구성 운영하는 등 전 역량을 동원하여 총력대응 체계에 들어갔다.

주요 내용은 단계 상향조정에 따라 신종플루 유행 조기 종식과 피해 최소화를 위해 중증환자 비상대응체계 구축 및 학교예방접종 조기 완료에 주력 하는 등 시민건강과 생명보호를 위해 가능한 모든 조치를 다 할 예정이다.

이에 따라 11. 11부터 안동진명학교와 영명학교 등 특수학교 학생을 우선적으로 시작하여 12. 9까지 4주간에 걸쳐 관내 초.중.고등학교 67개교 24,000여명을 대상으로 학교예방접종을 실시할 예정이며, 관내 공중보건의 18명 등 총 100여명이 참여하는 18개 접종팀을 구성(1개팀은 의사 1, 간호사 2, 행정지원인력 2 등 5명으로 구성) 운영할 예정이다.

또한 10.26부터는 관내 58개 모든 약국에 신종플루 치료제인 항바이러스제 50명분 씩을 배정하여 동네 의료기에서 진료를 받고 신종플루로 의심되면 처방을 받아 바로 동네 약국에서 약품을 구할 수 있도록 조치 하였다.